Postdoc inom statistisk ekologi och populationsmodellering – Stora rovdjur

Naturhistoriska riksmuseet är en statlig myndighet med uppdrag att främja kunskap, forskning och intresse för vår värld. Det är en framträdande forskningsinstitution och Sveriges största museum. Under mer än 200 år har museet samlat in prover och data samt bedrivit forskning om livet på jorden. Samlingarna innehåller mer än 11 miljoner växter, djur, svampar, miljöpåverkan, mineraler och fossil. All forskning och kunskap delas i utställningarna, Cosmonova och i aktiviteter på museet samt digitalt.

Avdelningen för populationsanalys och övervakning bedriver forskning, övervakning och genetiska analyser av marina och landbaserade däggdjur. Avdelningen består av flera arbetsgrupper som fokuserar på artövervakning, bevarande och genetisk identifiering. Aktiviteterna inkluderar övervakning av näbbval, sälar, björnar, havsörnar och räv, samt genomförandet av genetiska analyser för ett brett spektrum av bevarande- och miljöapplikationer genom Centret för genetisk identifiering (CGI). Avdelningen har för närvarande fyra postdoktorala forskare och flera seniora forskare med expertis inom ekologi, genetik och miljöövervakning.

Arbetsuppgifter

Hantering av stora rovdjur som brunbjörn, varg och järv kräver tillförlitliga, transparenta och rumsligt explicita uppskattningar av populationsstorlek och dynamik. Skandinavien har en av världens största långsiktiga genetiska övervakningsdataset för stora rovdjur. Däremot utnyttjar de nuvarande statistiska metoderna inte fullt ut rikedomens i dessa data.

BearKin-projektet, som finansieras av Naturvårdsverket, syftar till att utveckla skalbara och ekologiskt realistiska statistiska metoder för att uppskatta rumslig-tidsmässig abundans av stora rovdjur, med främst fokus på den skandinaviska brunbjörnen. Projektet integrerar:

• Öppen-population Spatial Capture-Recapture (OPSCR)
• Close-Kin Mark-Recapture (CKMR)
• Avancerad Bayesian beräkning och anpassade Markov-Chain Monte Carlo (MCMC)-algoritmer
• Rumsliga modeller med heterogena detekteringsprocesser
• Webbaserade verktyg för transparent spridning av abundansuppskattningar

Alla metoder kommer att implementeras i R med hjälp av NIMBLE-ramverket och integreras i det öppna källkods-paketet nimbleSCR.

Som postdoktor inom detta projekt kommer du att spela en central roll i den metodologiska utvecklingen, inklusive:

• Utveckling av beräkningsmässigt effektiva OPSCR-modeller för övervakningsdata i stor skala
• Implementering av anpassade MCMC-sampels och reparameteriseringar i NIMBLE
• Modellering av rumsligt heterogena detekteringsprocesser (t.ex. Gaussiska slumpfält)
• Integration av ekologiska begränsningar och släktskapsinformation i dynamiska populationsmodeller
• Publicering av resultat i ledande tidskrifter inom statistisk ekologi och beräkningsstatistik
• Bidrag till utveckling av mjukvara med öppen källkod (nimbleSCR, rovquantR)
• Deltagande i workshops och kommunikation med intressenter

Du kommer att samarbeta tätt med Martin Sköld (Naturhistoriska riksmuseet) och RovQuant-projektet (Applied Quantitative Ecology Group, norska universitetet för livsvetenskap).

Krav

• PhD i statistik, beräkningsmatematik eller liknande, eller PhD i ekologi eller liknande, med exceptionella kvantitativa och beräkningsmässiga färdigheter. Det anses vara en fördel om doktorsexamen är högst tre år gammal vid ansökningsdatum.
• Dokumenterad erfarenhet av flera av följande områden: Bayesian statistik, hierarkisk modellering, rumslig statistik, Markov-Chain Monte Carlo-metoder och fångst-återfångst eller populationsmodellering.
• Starka programmeringsfärdigheter i R
• Erfarenhet av att förbereda vetenskapliga artiklar för peer-review
• God vana vid att skriva och tala engelska.

Meriterande kvalifikationer

• Erfarenhet av NIMBLE, Stan eller andra ramverk för sannolikhetsprogrammering
• Erfarenhet av spatial fångst-återfångst (SCR/OPSCR)
• Erfarenhet av genetisk eller släktskapsbaserad populationsinferens
• Erfarenhet av utveckling av R-paket
• Intresse för tillämpad viltförvaltning och bevarande.

Vi söker någon som tar initiativ, är strukturerad och har starka samarbetsförmågor. Du initierar aktiviteter och uppnår resultat. Du planerar, organiserar och prioriterar ditt arbete effektivt, och du sätter och håller tidsfrister. Du arbetar bra med andra och kommunicerar på ett professionellt sätt.

Anställningsform: Tillfällig anställning.
Varaktighet: 6 månader eller längre.
Startdatum: Snarast möjligt. Tjänsten är en tidsbegränsad anställning på två och ett halvt år.

Vi fördjupar vår kunskap om naturvärlden, inspirerar till bättre omsorg om vår planet. Vår ambition är att anställda på Naturhistoriska riksmuseet ska spegla mångfalden i Sverige och vi välkomnar alla sökande.

Vi har fattat beslut om val av marknadsföring. Därför tackar vi nej till kontakt med säljare, rekryteringsplatser och liknande.