Ledigt jobb: Doktorand

Avdelningen för vatten och miljö

Ämnesområde för tredje cykeln

Biologi

Beskrivning av doktorandprojektet

Antibiotikaresistens (AMR) är en av de mest akuta globala hälsoutmaningarna idag. En viktig drivkraft för spridningen av antibiotikaresistens är den horisontella överföringen av resistensgener via konjugativa plasmider – mobila genetiska element som rör sig mellan bakterier. Plasmidberoende fager (PDP) är virus som specifikt infekterar bakterier som bär på dessa plasmider, vilket gör dem till ett potentiellt kraftfullt men hittills förbisedd verktyg för att kontrollera spridningen av resistensgener.

Detta doktorandprojekt ingår i ECOPHARM, ett forskningsprojekt finansierat av Knut och Alice Wallenbergs stiftelse (Wallenberg Academy Fellows 2025) och är baserat vid Avdelningen för vatten och miljö, SLU Uppsala. Det övergripande målet med ECOPHARM är att belysa mekanismerna bakom PDP:s interaktioner med konjugativa plasmider och bakteriella värdar, samt att förstå deras påverkan på spridningen av antibiotikaresistensgener i vattenmiljöer.

Som doktorand kommer du att undersöka mångfalden, ekologin och de funktionella interaktionerna hos plasmidberoende fager i vattensystem. Arbetet kommer att kombinera fältprovtagning, odlingbaserade metoder, metagenomik, genomanalys och experimentella infektionsförsök. Du kommer att arbeta i en dynamisk och internationellt förankrad forskningsmiljö i skärningspunkten mellan mikrobiell ekologi, virus-värd-koevolution och AMR-forskning. För att läsa mer om vår forskning, besök vår webbplats: https://www.bionomics-mmlab.com/

Om tjänsten

Doktoranden förväntas:

• Planera och genomföra fältprovtagning av vattenmiljöer för att karaktärisera PDP-samhällen
• Utföra laboratorieexperiment för att studera PDP–plasmid–värd-interaktioner under kontrollerade förhållanden
• Använda metagenomiska och bioinformatiska verktyg för att analysera data om mikrobiella och virala samhällen
• Deltaga i experimentellt arbete med isolering, odling och infektionsförsök av fager
• Presentera resultat vid laboratoriemedlingar, nationella och internationella konferenser samt bidra till vetenskapliga publikationer
• Uppfylla labbetets riktlinjer för hantering av forskningsdata
• Kommunicera framsteg och flaskhalsar i tid och tydligt
• Samarbeta med nationella och internationella projektpartners inom ECOPHARM-nätverket

Krav

För att uppfylla de allmänna antagningskraven måste du ha erhållit en examen på andra cykeln (magister/master), ha uppfyllt kraven för kurser om sammanlagt minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på andra cykeln, eller förvärvat i väsentlig mån motsvarande kunskaper på annat sätt i Sverige eller utomlands (Högskoleförordningen 1993:100, kapitel 7, § 39).

Specifika antagningskrav för tredje cykelns kurser och utbildningsprogram inom biologi. För att uppfylla de specifika antagningskraven måste du ha minst 90 högskolepoäng inom biologi-relaterade ämnen. Detta måste innefatta ett examensarbete och minst 30 högskolepoäng måste vara på andra cykelns nivå.

Du måste också uppfylla motsvarande engelskkunskapskrav som krävs för den svenska gymnasieutbildningens kurs Engelska B/6.

Din profil

Obligatoriskt:

• En masterexamen inom mikrobiologi, biologi, molekylärbiologi, miljövetenskap eller ett närliggande område
• God bakgrund inom mikrobiologi eller molekylärbiologi
• Erfarenhet av laboratorietekniker relevanta för mikrobiell eller miljöforskning
• God förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska

Meriterande:

• Erfarenhet av bioinformatik eller beräkningsmässig analys av sekvenseringsdata
• Kännedom om fagbiologi, plasmidbiologi eller forskning kring antibiotikaresistens
• Erfarenhet av provtagning i vatten- eller miljömiljöer

Persönliga egenskaper vi söker:

• Hög egen drivkraft — du tar initiativ, definierar problem självständigt och driver arbetet framåt i dialog med handledare
• Samarbetsvillig inställning — du bidrar aktivt till ett teammiljö och stödjer dina kollegor
• Tycklig kommunikatör — du kan förmedla komplexa idéer i text och muntligt, både till fackpublik och allmänhet
• Nyfikenhet, noggrannhet och uthållighet inför vetenskaplig osäkerhet

Om oss

Avdelningen för vatten och miljö arbetar med tillämpad miljövetenskap, med ett nationellt ansvar för att bedöma tillståndet i svenska ytvatten avseende vattenkemi, föroreningar och vattenlevande organismer. Forskningen fokuserar på geochemiska och hydrologiska processer, vattenekologi och biodiversitet, mikrobiell ekologi samt miljö kemi och vattenekotoksikologi. Avdelningen har cirka 150 anställda, varav ungefär hälften är forskare/doktorander och den andra hälften är teknisk och administrativ personal.

För mer information om avdelningen, besök: http://www.slu.se/aquatic-sciences

Läs mer om anställningsförmåner och livet som anställd på SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Läs mer om tredje cykelns kurser och utbildningsprogram på http://www.slu.se/utbildning/program-kurser/forskarutbildning/

Anställningsform / Finansiering

Anställning som doktorand (4-årigt program)

Doktoranders löner sätts enligt lokal kollektivöverenskommelse. Löneutvecklingen är fastställd.

Plats:

Uppsala

Omfattning:

100%

Startdatum:

1 oktober 2026

Sökprocess och urval:

Vänligen skicka in din ansökan via länken nedan. Sista ansökningsdag är 30 augusti 2026.

Din ansökan bör innehålla:

• En en-sidig reflektion som innefattar (1) varför du planerar att genomgå en doktorandutbildning, (2) varför du specifikt anser att vår grupp är en bra målgrupp för dig och (3) varför detta projekt intresserar dig
• Skicka 2 publikationer relaterade till ämnet "plasmidberoende fager" som du finner mest intressanta
• Alla ansökningsdokument ska vara utformade på engelska

Läs mer om övriga bilagor som din ansökan ska innehålla på https://www.slu.se/en/study/programmes-courses/doctoral-education/how-can-i-become-a-doctoral-student/application/

Urvalet bland behöriga sökande baseras på de bilagor som bifogas ansökan, och sker med hänsyn till sökandens förmåga att fullfölja programmet inom den angivna tiden.

Representanter för akademiska fackförbund:

https://internt.slu.se/en/my-employment/employee-associations/kontaktpersoner-vid-rekrytering/