Ledigt jobb: Forskare, växt- och djurbiologi

Avdelningen för animalvetenskap

Vi söker en motiverad och engagerad forskare som vill förstå de genetiska konsekvenserna av vildning och hur dessa processer kan förända fenotypen hos tam- och vildhöns.

Om tjänsten

Tjänsten innebär att arbeta med och leda ett projekt där du analyserar genoms, transkriptom och metyleringsdata som erhållits från vilda fåglar från Hawaii och Bermuda. Du kommer att använda denna data i kombination för att fastställa den genetiska grunden för vildning, och särskilt den roll som kritiska regioner spelar i formandet av fenotypisk variation. Vidare kommer en stor mängd data från enskilda celler (single-cell data) att analyseras för att förstå hur den genetiska grunden för vildning motsvarar de skillnader som framkallas av domesticering från ett vilt tillstånd. De regioner och gener som identifieras kommer sedan att användas för att bidra till att producera en transgen höna för att göra en tamhöna vild, som en del av ett pågående projekt med Revive & Restore. Möjligheter till forskningsbes utomlands kan finnas. Forskningen involverar bioinformatiskt arbete med stora mängder genoms-, transkriptom- och metylomdata, samt analys av enskilda celler.

Din profil

Du måste ha en doktorsexamen (PhD) inom djurvetenskap, veterinärmedicin, naturvetenskap eller teknik. Du måste också ha dokumenterad skicklighet i att skriva och tala engelska.

Projektet innebär att utforska de evolutionära mekanismerna bakom vildning och domesticering hos höns, genom att analysera WGS-data och RAD-seq-data (genomik), RNA-seq-data (transkriptomik), MeDIP-seq-data (metylomik) samt scRNA-seq och scATAC-seq-data (single-cell-omik) från hönspopulationer. Krävd metodik och färdigheter inkluderar kvantifiering av genuttryck (både bulk RNA-seq och scRNA-seq) och kromatinåtkomst (scATAC-seq) i olika vävnader, undersökning av differentierat genuttryck (t.ex. med DESeq2 och EdgeR), identifiering av potentiella selektionssvep med hjälp av flera metoder (SweepFinder2, SweeD, OmegaPlus, Rehh, Tajima’s D), analys av homozygositetssegment (ROH) och beräkning av inavelskoefficienter (FROH), beräkning av olika populationsgenetiska mått (t.ex. heterozygositet, LD-kurva), genomförande av QTL-analyser (Kvantitativa draglokus) och GWAS (Genomvida associationsstudie) för att identifiera associationer mellan genotyper och morfologiska och beteendemässiga drag (med hjälp av både MatrixEQTL och GEMMA), samt analys av uttrycksmönster (med MatrixEQTL).

Kännedom om olika versioner av hönsens referensgenom och beräkning i miljöer för högpresterande beräkning (HPC) såsom PDC och UPPMAX krävs också, liksom avancerade programmeringsfärdigheter i språken R, Bash (Linux), Python, Matlab och Mathematica. Eftersom projektet pågår är alla ovanstående färdigheter krav, och endast kandidater som uppfyller alla ovanstående kommer att beaktas.

Vikt läggs också vid personliga egenskaper såsom engagemang, samarbetsförmåga, analytiska förmåga, självständighet, initiativförmåga och organisatoriska färdigheter. Tjänsten kommer att erbjudas den kandidat som efter en kvalitativ bedömning anses vara mest lämpad att utföra och utveckla projektuppgifterna samt bidra till en positiv utveckling av ämnesområdet.

Om oss

Avdelningen för animalvetenskap är en del av Fakulteten för veterinärmedicin och djurvetenskap och ansvarar för utbildning och forskning inom flera grundläggande och tillämpade områden. Dessa områden inkluderar anatomi, fysiologi, biokemi, patologi, farmakologi, toxikologi, genetik, avel, immunologi, bakteriologi, virologi, parasitologi, epizootologi, jämförande medicin, livsmedelssäkerhet, bioinformatik och One Health. Vår forskning täcker allt från produktionsdjur till idrotts- och sällskapsdjur, laboratoriedjur och vilda djur. Avdelningens forskare arbetar inom hela spektrumet, från molekylära mekanismer och mikrobiologi till djurens struktur, funktion och beteende och hur dessa påverkas av avel, fysisk aktivitet, vård, produktion, stress, miljöfaktorer och sjukdomar.

För mer information om avdelningen eller divisionen besök: Länk till hemsida (https://www.slu.se/en/about-slu/organisation/departments/Animal-Biosciences/)

Läs mer om våra förmåner och att arbeta på SLU genom att besöka: Länk till hemsida (https://www.slu.se/en/about-slu/work-at-slu/)

Plats:

Uppsala, Ultuna

Anställningsform:

Tillsvidareanställning. SLU kan använda provanställning.

Omfattning:

100%

Startdatum:

Enligt överenskommelse.

Sökprocess:

Vänligen skicka in din ansökan senast den 12 juni 2026. Du kan skicka in din ansökan genom att klicka på knappen nedan.

Fackliga kontaktpersoner:

Länk till hemsida (https://internt.slu.se/en/my-employment/employee-associations/kontaktpersoner-vid-rekrytering/)

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen mot ett hållbart liv, baserat på vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspel mellan människor, djur och ekosystem samt ansvarsfull användning av naturresurser bidrar vi till hållbar samhällsutveckling och goda levnadsvillkor på vår planet. Våra huvudcampus finns i Alnarp, Umeå och Uppsala, men universitetet verkar också vid forskningsstationer, experimentalskogar och undervisningsplatser över hela Sverige. SLU har cirka 4 000 anställda, 6 000 studenter och doktorander samt en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Vi investerar i attraktiva miljöer på alla våra campus. Vi strävar efter att erbjuda en arbetsmiljö präglad av inkludering och jämställdhet, där olika erfarenheter skapar samtal mellan människor och banar väg för vetenskap, kreativitet och utveckling. Därför välkomnar vi sökande med olika bakgrunder och perspektiv.