Ledigt jobb: Biokemist

National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS) rekryterar en bioinformatikexpert till ett nationellt team för bildanalys av elektronmikroskop och multimodal 3D-data med arbetsplats vid SciLifeLab Umeå

Arbetsbeskrivning

Umeå universitet söker en staff scientist för arbete med avancerad 3D-bildanalys av data från elektronmikroskop, tomografi, cryo-EM, SEM-genererade bildvolymer samt korrelation av bilddata för multimodal avbildning. Som staff scientist ingår du i en grupp av teknisk personal som arbetar med nationell forskningsinfrastruktur vid Umeå Centre for Electron Microscopy (UCEM) och arbetar integrerat i SciLifeLabs Bioinformatics Platform (National Bioinformatics Infrastructure Sweden: www.nbis.se). Detta är en nationell plattform med över 120 bioinformatikexperter som tillsammans bidrar med unikt bioinformatiskt stöd och utbildning för forskning inom hela life science-spektrat, samt deltar i internationella samarbeten. Inom NBIS kommer du att tillhöra gruppen BiopImage Informatics (https://www.scilifelab.se/units/bioimage-informatics/ (https://www.scilifelab.se/units/bioimage-informatics/)). Anställningen finansieras med bidrag från NBIS via SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för Data Driven Life Science (DDLS), https://www.scilifelab.se/data-driven/ (https://www.scilifelab.se/data-driven/).

Arbetsuppgifter

Som staff scientist kommer du att förse forskare med expertråd i planeringen och analysen av elektronmikroskopi (EM) och multimodal data inom hela life science-forskningens fält, exempelvis biologi, biokemi och medicinska projekt. Du kommer att bistå forskare i EM-projekt med bildanalys och vara delaktig i undervisning på metodikkurser på forskarutbildningsnivå. Projektstödet prioriteras på nationell nivå. Du kommer att utföra projektstöd och serviceuppgifter för forskare individuellt och planera ditt arbete tillsammans med NBIS BioImage Informatics-team. Arbetsuppgifterna inkluderar team- och användarmöten både lokalt och nationellt, dataanalys individuellt och i samarbeten, samt skriva och förbereda presentationer, protokoll och vetenskapliga rapporter. I denna roll är det viktigt att hålla sig uppdaterad om utvecklingen av EM- och bildanalysprogram, testa och implementera nya metoder, samt kommunicera med både programmerare och infrastrukturens användare om utvecklingen inom bildanalysfältet. Du kommer att hjälpa till med mjukvaruinstallationer, metodutveckling och underhåll av digitala verktyg och arbetsflöden. Du kommer också att koordinera pågående projekt vid den lokala forskningsinfrastrukturen och för samarbeten mellan flera infrastruktursnoder i Sverige och internationellt. Din arbetsplats kommer att vara vid UCEM i Umeå. Vårt arbetsspråk är engelska.

Kvalifikationer

Vi söker dig med doktorsexamen i cell- och strukturbiologi, biokemi, bioimaging, bioteknologi, datavetenskap eller motsvarande. Du har erfarenhet av användning och utveckling av avancerad bildanalys för elektronmikroskopi (EM) och korrelativ avbildning. Erfarenhet och bakgrundskunskaper om provpreparering och instrumenthantering inom EM (SEM, TEM, Cryo-EM) för life science-forskningsprojekt är nödvändigt för att förstå och använda metoderna. Omfattande (3+ års) erfarenhet av att använda och/eller utveckla avancerade digitala bildanalysmetoder är ett krav, liksom dokumenterad erfarenhet av tomografisk 3D-rekonstruktion och av att använda flera olika programvaror för 3D-bildanalys, segmentering och visualisering. Dessutom krävs mycket god samarbets- och kommunikationsförmåga på engelska.

För denna anställning ska du vara självständig och flexibel, för att ta dig an nya utmaningar, etablera nya metoder och medverka i flera olika projekt parallellt. Du är en person som kan ta initiativ, vara kreativ och har en serviceinriktad attityd, med vilja att hjälpa användare och forskargrupper med projekt inom bioinformatik för att nå nya resultat.

Övriga önskvärda kvalifikationer

Relevanta postdoc-projekt eller motsvarande erfarenhet är meriterande men inte ett krav. Erfarenhet av olika typer av mikroskopi, till exempel provpreparering och instrumenthantering, är meriterande. "Reproducerbar forskning" och "FAIR-data" är centrala begrepp för oss, och expertis inom programmering av reproducerbar kod med hjälp av olika plattformar, versionskontroll, kodningsspråk och containerlösningar är meriterande. Erfarenhet av att träna inlärningsbaserade modeller på HPC-system är också meriterande. Ett väletablerat internationellt nätverk inom EM, och tidigare internationella samarbeten inom eller med forskningsinfrastruktur, värderas högt.

Ansökan

Ansökan ska innehålla ett personligt brev med motivering till varför du söker anställningen, ett CV, doktorsexamensbevis samt relevanta intyg och betyg.

Ansökan ska vara inkommen via vårt e-rekryteringssystem Varbi senast den 15 juni 2026.

Villkor

Anställningen avser heltid i 12 månader. Tillträde enligt överenskommelse.

Information

Närmare upplysningar lämnas av Linda Sandblad, tfn: 090-786 71 07 eller e-post: [email protected]