Doktorand inom systembiologi och industriell bioteknik

Gå med oss på en spännande doktorandresa som kombinerar systembiologi, beräkningsmodellering och industriell bioteknik för att lösa en nyckelutmaning inom hållbar bioproduktion.

Om oss

Institutionen för livsvetenskaper bedriver forskning, innovation och utbildning för att möjliggöra ett biobaserat samhälle och förbättra människors hälsa. Vi utforskar hur biologiska system och innovativa teknologier kan användas för att omvandla biomassa till värdefulla produkter. Vi använder avancerade beräkningsteknologier för att upptäcka hur biomolekyler och organismer fungerar och interagerar. Vi är pionjärer inom nya metoder för förutsägelse, förebyggande, diagnostik och behandling av sjukdomar.

Om forskningsprojektet

Mikrobiella cellfabriker är centrala i den globala övergången mot ett hållbart samhälle. Bland dem utmärker sig icke-konventionella jästsorter som Yarrowia lipolytica och Debaryomyces hansenii som kraftfulla biokatalysatorer tack vare deras unika egenskaper: hög lipidackumulering, stresstolerans och anpassningsförmåga till utmanande industriella förhållanden.

En kritisk utmaning i storskaliga bioprocesser är reglerad celldöd (RCD). För tidig celldöd kan drastiskt minska produktiviteten, förkorta fermenteringscykler och till och med kompromettera produktkvaliteten. Att förstå och kontrollera RCD är därför avgörande för nästa generations bioproduktion.

Din uppgift som doktorand kommer att vara att använda verktyg inom beräkningsbiologi för att utforska skärningspunkten mellan celldöd, metabolism och populationsheterogenitet i industriella jäster. Du kommer att:

• Utveckla avancerade beräkningsmodeller, inklusive mekanistiska enzymbegränsade modeller (ecGEMs) för Y. lipolytica och D. hansenii, som integrerar RCD-vägar.
• Utnyttja banbrytande data från experiment och litteratur för att modellera metabolism och celldöd under verkliga bioprocessförhållanden.
• Avslöja molekylära mekanismer och biomarkörer för RCD, samt utforma innovativa strategier för att fördröja celldöd och öka bioproduktionsprestanda.

Som en del av Marie-Curie doktorandnätverket UPsYDe kommer du att samarbeta med ledande laboratorier och industripartners över hela Europa. Projektet inkluderar två 3-månaders praktikplatser i jästbioteknik och fermenteringsforskningsgruppen under Prof José Luis Martinez (DTU, Danmark) och på dsm-firmenich (Nederländerna).

Vem vi söker

Följande krav är obligatoriska:

• För att kvalificera dig som doktorand måste du ha en masterexamen (120 hp) eller en magisterexamen (60 hp) inom bioteknik; mikrobiologi; biokemi; systembiologi; beräkningsbiologi; matematik eller relaterade områden.
• Du är erfaren och bekväm med att köra analyser inom beräkningsbiologi på t.ex. Python, MATLAB och/eller R.
• Du är nyfiken, motiverad och ivrig att bemästra nya beräkningsmetoder.
• Du är flexibel och samarbetsvillig, med starka kommunikationsfärdigheter (skriftligt och muntligt på engelska).

*För studenter med utbildning utanför Sverige accepteras en 4-årig kandidatexamen.

Följande erfarenhet kommer att stärka din ansökan:

• Du har praktisk erfarenhet av att utveckla genomskala begränsade modeller för att ta itu med komplexa biologiska frågor.
• Du har erfarenhet av att skriva egen kod, inklusive användning av versionskontroll (t.ex. git).
• Du har varit involverad i ett projekt inom metabolisk ingenjörskonst (t.ex. iGEM).

Vad du kommer att göra

• Delta i kurser på avancerad nivå inom Graduate school of Bioscience.
• Utveckla dina egna vetenskapliga koncept och kommunicera resultaten av din forskning muntligt och skriftligt.
• Delta i utbildningsevenemang som organiseras som en del av UPsYDe MS-CA doktorandnätverket.
• Positionen inkluderar också undervisning på Chalmers grundnivå eller andra uppgifter som motsvarar 20 procent av arbetstiden.

Anställningsvillkor

• Doktorandpositionerna är fullt finansierade från start.
• Positionen är en tidsbegränsad anställning på fyra år, med möjlighet att undervisa upp till 20%, vilket förlänger positionen upp till fem år.
• En startlön på 34,550 SEK per månad (gäller från 25 maj 2025), med ett 3-årigt MSCA-lönetillägg och familjetillägg (om tillämpligt).
• Doktorandstudier kräver fysisk närvaro under hela studieperioden. Ett giltigt uppehållstillstånd måste uppvisas senast vid studiestart; annars kan antagningen dras tillbaka.

Vad vi erbjuder

• Som doktorand vid Chalmers är du anställd och njuter av alla anställningsförmåner. Läs mer om att arbeta på Chalmers och våra förmåner för anställda.
• En dynamisk och inspirerande arbetsmiljö i den kustnära staden Göteborg.
• Läs mer om Sveriges generösa föräldraledighet, subventionerad barnomsorg, gratis skolor, sjukvård etc. på Move To Gothenburg.

Chalmers är engagerat i att förbättra könsbalansen och arbetar aktivt med jämlikhetsprojekt, såsom GENIE-initiativet för jämställdhet och excellens. Vi firar mångfald och ser jämlikhet och inkludering som grundläggande aspekter av alla våra aktiviteter.

Om svenska inte är ditt modersmål erbjuder Chalmers svenska kurser för att hjälpa dig att bosätta dig.

Hitta mer allmän information om doktorandstudier vid Chalmers här.

Ansökningsförfarande

För information om ansökningsförfarandet, vänligen hänvisa till annonsen på Chalmers webbplats.

Vi välkomnar din ansökan senast den 6 mars 2026.

För frågor, vänligen kontakta: Dr Eduard Kerkhoven, seniorforskare och gruppledare, [email protected]

Vi ser fram emot din ansökan!