Postdoktor i experimentell evolution av antibiotikaresistens

Institutionen för molekylärbiologi söker en postdoktor som ska arbeta med prediktion och styrning av experimentell evolution av antibiotikaresistens.

Anställningen är på heltid i två år och beräknas starta 1 juni 2025 eller enligt överenskommelse.

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Evolution av antibiotikaresistens är oundviklig under långtidsbehandling och bidrar till dödsfall vid kroniska infektioner. Bakterier kan dock bara anpassa sig till nuvarande förhållanden. Om vi ​​kunde styra deras evolution skulle det kanske vara möjligt att lura dem till evolutionära återvändsgränder där de inte längre kan utveckla resistens eller bara göra det till en kostnad av minskad tillväxthastighet eller förmåga att orsaka sjukdom.

Detta tvärvetenskapliga projekt kommer att utveckla ett ramverk för att förutsäga och styra utvecklingen av multidrogresistens i den opportunistiska patogenen Pseudomonas aeruginosa med hjälp av en kombination av matematisk modellering, experimentell evolution och genomik. Projektet är ett samarbete mellan Peter Linds grupp vid Institutionen för molekylärbiologi och Eric Libby’s grupp vid Integrated Science Lab (IceLab) med finansiering från Vetenskapsrådet.

I projektet kommer matematiska och experimentella biologer att arbeta tillsammans för att kombinera experimentella data med mekanistiska matematiska modeller av de molekylära nätverk som driver resistensutvecklingen för att förutsäga utvecklingen av bakteriepopulationer i laboratoriet. Senare kommer fokus att ligga på att styra bakteriepopulationer till önskvärda genetiska bakgrunder genom att förutsäga de miljöförhållanden som sannolikt kommer att leda till en viss evolutionär bana.

Postdoktorn förväntas i första hand bidra till den experimentella delen av projektet men arbeta i samarbete med teoretiker.

Närmare upplysningar lämnas av universitetslektor Peter Lind, peter.lind@umu.se (mailto:peter.lind@umu.se).

Kvalifikationer

För att anställas med stöd av avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

För att anställas med stöd av postdoktoravtalet bör främst den komma ifråga som har avlagt examen enligt föregående stycke för högst tre år sedan. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.

Den framgångsrike kandidaten ska ha en doktorsexamen i mikrobiologi, molekylärbiologi, evolutionsbiologi eller liknande forskningsområden. Kvalificerade sökande ska ha dokumenterad erfarenhet inom ett eller flera områden relaterade till projektet såsom experimentell evolution, bakteriell genetik, genomik eller mikrobiologiska och molekylärbiologiska tekniker. Erfarenhet av high-throughput assays och dataanalys, programmering eller tvärvetenskapliga samarbeten är meriterande. Den sökande ska också ha ett stort intresse av att förstå och förutsäga evolutionära processer på olika biologiska nivåer.

Framgångsrika kandidater måste kunna bedriva oberoende vetenskaplig forskning och ha god förmåga att skriva vetenskapliga manuskript. All kommunikation i forskargruppen sker på engelska och därför krävs goda kommunikationsförmåga i skrift och tal på engelska.

Vetenskapliga kvalifikationer kommer att vara det huvudsakliga bedömningskriteriet och baseras i första hand på kvalitet och kvantitet av vetenskapliga publikationer med hänsyn till tiden sedan doktorsexamen. Bedömningen av ansökningarna kommer att följa riktlinjerna från Coalition for Advancing Research Assessment (CoARA) som Umeå universitet har skrivit under. De generella utvärderingskriterierna är god samarbetsförmåga samt besittning av den förmåga och lämplighet som krävs för att utföra arbetsuppgifterna samt ett stort intresse för forskningsområdet evolutionär prediktion.

Ansökan

Ansökan ska vara skriven på engelska eller svenska. Ansökan görs genom vårt elektroniska rekryteringssystem. Sista ansökningsdag är 10 April 2025. En fullständig ansökan ska innehålla:

• Personligt brev där du beskriver dina kvalifikationer och forskningsintressen samt en motivering till varför du är intresserad av denna tjänst
• Curriculum vitae (CV) med information om utbildning, tidigare och nuvarande befattningar samt för anställningen relevanta meriter
• En lista över publikationer med en kort beskrivning av ditt bidrag till dina viktigaste publikationer och preprints
• Styrkt kopia av doktorsexamensbevis eller dokumentation som styrker när doktorsexamen förväntas erhållas
• Styrkta kopior av andra examensbevis, akademiska kursintyg och/eller betyg
• Kopia av doktorsavhandling (om tillgänglig) och maximalt 3 relevanta artiklar/preprints
• Kontaktuppgifter till två referenspersoner

Välkommen med din ansökan!

Mer information

Institutionen tillhör de medicinska och teknisk-naturvetenskapliga fakulteterna och erbjuder en vital forskningsmiljö med en bred uppställning av toppmoderna imaging-, metabolomik-, genomik- och screeningsanläggningar. Institutionen är även värd för Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS), med goda internationella kontakter via ett partnerskap med European Molecular Biology Laboratory (EMBL) inom molekylär medicin.

Läs mer om oss på: http://www.umu.se/molbiol (http://www.umu.se/molbiol)