PhD-studenter sökes till Antibiotic Research Group

Antibiotic Research Group, ledd av docent Michaela Wenzel, söker två PhD-studenter för att arbeta med ett projekt om AI-assisterad upptäckte och karakterisering av peptider som är effektiva mot mykolsyrelagret hos mykobakterier, särskilt Mycobacterium tuberculosis.

Information om projektet och avdelningen

I ett gemensamt projekt kommer två PhD-studenter att utforska nyupptäckta peptider, så kallade MAPPs (mykolsyrelager-permeabiliserande peptider). Dessa peptider kan inaktivera det yttre lagret av mykobakterier, som orsakar livshotande sjukdomar som tuberkulos och lepra. Detta lager, som består av mykolsyra (därav namnet mykolsyrelager), gör mykobakterier extremt ogenomträngliga för läkemedel, vilket förhindrar användningen av de flesta antibiotika. MAPPs är en ny strategi för att avlägsna mykobakterier från detta skyddande lager och öppna upp för användning av läkemedel som annars aldrig skulle fungera mot dessa dödliga patogener. Dessutom visar MAPPs selektivitet för mykobakterier över andra typer av bakterier, vilket lovar ökad effektivitet och betydligt färre biverkningar för patienter och deras mikrobiom. Projektet omfattar AI-assisterad upptäckte och design, screening, analys av verkningsmekanismer och preklinisk karakterisering av MAPPs.

Antibiotic Research Group är en del av Division of Chemical Biology, som erbjuder en dynamisk forskningsmiljö med flera unga och aktiva forskargrupper som arbetar med biomolekyler och deras funktioner i cellulära miljöer. Divisionen har en bred expertis som sträcker sig från enskild molekylbiophysik till cell- och organismbiologi. Divisionen ger tillgång till avancerade tekniker och instrumentering, t.ex. olika avancerade mikroskopitekniker, nanoteknik och protein- och membranbiophysik.

Huvudsakliga ansvarsområden

En PhD-position kommer att kombinera arbete i torrt laboratorium som involverar artificiell intelligens och iterativa maskininlärningsmodeller med mikrobiologiskt arbete i vått laboratorium. Den andra PhD-positionen planeras att vara helt baserad i vått laboratorium med fokus på mikrobiologi och membranbiophysik. Projektet involverar AI/ML, in silico peptidanalyser, robotassisterad föreningsscreening, fluorescensmikroskopi och spektroskopi, elektronmikroskopi, atomkraftmikroskopi samt olika mikrobiologiska, biokemiska och biophysikaliska tekniker.

Även om de två PhD-projekten kommer att vara distinkta, förväntas samarbete inom ramen för det övergripande projektet och ömsesidig utbyte av idéer, färdigheter och expertis. Den exakta fördelningen av uppgifter mellan positionerna, inklusive förhållandet mellan torrt och vått laboratorium, är föremål för diskussion baserat på de framgångsrika sökandes färdigheter och ambitioner.

Förutom att utföra sin egen forskning förväntas de framgångsrika kandidaterna delta i handledningen av kandidat- och masteruppsatser samt ta på sig ansvar inom laboratorie- och instrumenthantering. PhD-studenter kan också delta i undervisning av kurser.

Kvalifikationer

De framgångsrika kandidaterna måste ha (eller vara nära att slutföra) en Master of Science eller motsvarande examen inom ett relevant ämnesområde (t.ex. Biologi, Biokemi, Biomedicin). En examen inom ett relaterat ämnesområde (t.ex. Kemi, Bioinformatik, Datavetenskap) är också giltig, om kursen och/eller examensarbetet är relaterat eller tydligt tillämpligt på biologisk/biomedicinsk forskning.

Praktisk erfarenhet inom antingen mikrobiologi, AI/ML, läkemedelsupptäckte/design eller membranbiologi/biophysik är ett krav. Praktisk erfarenhet inom mer än ett av dessa områden är idealiskt men inte obligatoriskt.

Utmärkt kunskap i engelska språket både muntligt och skriftligt är ett krav. Svenska språkkunskaper är inte nödvändiga. Chalmers erbjuder frivilliga svenska kurser för PhD-studenter.

Anställningsvillkor

Heltids tillfällig anställning. Positionen är begränsad till högst fem år. Startdatum är förhandlingsbara men positionerna bör påbörjas under 2025.

Vad vi erbjuder

Chalmers erbjuder en stimulerande och inspirerande arbetsmiljö i kuststaden Göteborg. Läs mer om att arbeta på Chalmers och våra förmåner för anställda.

Chalmers strävar aktivt efter att förbättra vår könsbalans. Vi arbetar brett med jämlikhetsprojekt, till exempel GENIE-initiativet för jämställdhet för excellens. Jämlikhet och mångfald är grundläggande i alla aktiviteter på Chalmers.

Ansökningsförfarande

Ansökan ska skrivas på engelska och bifogas som PDF-filer, enligt nedan. Maximal storlek för varje fil är 40 MB. Observera att systemet inte stöder Zip-filer.

• CV: (Vänligen namnge dokumentet: CV, Efternamn)
  • CV
  • Övrigt, till exempel tidigare anställningar eller ledarskapskvalifikationer och förtroendepositioner.
  • Två referenser som vi kan kontakta.
• Personligt brev: (Vänligen namnge dokumentet som: Personligt brev, Efternamn)
  1-3 sidor där du:
  • Introducerar dig själv
  • Beskriver din tidigare erfarenhet av relevans för positionen (t.ex. utbildning, examensarbete och, om tillämpligt, andra forskningsaktiviteter)
  • Beskriver dina framtida mål och framtida forskningsfokus
• Övriga dokument:
  • Kopior av kandidat- och/eller masteruppsatser.
  • Intygade kopior och betyg av avslutad utbildning, betyg och andra intyg, t.ex. TOEFL-testresultat.

Använd knappen längst ner på sidan för att nå ansökningsformuläret.

Observera: Sökande ansvarar för att säkerställa att ansökan är fullständig. Ofullständiga ansökningar och ansökningar som skickas via e-post kommer inte att beaktas.

Ansökningsdeadline: 05.05.2025

För frågor, vänligen kontakta:
Docent Michaela Wenzel, Chemical Biology,
Wenzelm@chalmers.se (mailto:Wenzelm@chalmers.se)

*** Chalmers avböjer att överväga alla erbjudanden om ytterligare annonsering eller andra typer av stöd för rekryteringsprocessen i samband med denna position. ***